Syaih Marzuq banyak memberikan sumbang sih pemikiran di dunia Islam. Beliau banyak menulis buku dalam berbagai cabang ilmu. Umumnya buku-buku beliau dikhususkan untuk para santri yang masih belajar tingkat pemula atau pertengahan. Tidak heran jika buku-buku karya beliau, terkesan mirip dengan buku diktat.
Di antara buku karya beliau adalah:
1. Manzhumatu Akidatil Awwam
2. Bayanul Asli fi bayani Lafzhi Bi Afdhal
3. Tashilu al-Adzhan Ala Matanillisan (buku nahwu)
4. Al-Fwaid al-arzuqiyyah Fi Syarhi Al-jurumiyyh
5. Manzhumatu Fi Qawaii ash-Sharfi wa an-Nahwi
6. Nuzhum fi al-Falak
7. Bulughul Maram Libayani al-Fzazhi maulidi Sayyidil Anam
8. Manzhumatu Ismatil Anbiya